
Župnišče, ki je ena izmed osrednjih stavb vzhodne vedute mesta nad Lahinjo, je svojo podobo (tlorisno
obliko in zasnovo) dobilo leta 1808. O pomenu tega dela mestnega prostora pričajo arheološke najdbe
prazgodovine, antike in srednjega veka, predstavljene v sosednjem Pastoralnem centru. Pastoralni center
je bil odprt leta 1998, ko so na lokaciji sredi starega mestnega jedra opravili arheološka izkopavanja. Le ta so
odkrila pomembne ostanke prazgodovinske, antične in srednjeveške naselitve današnjega Črnomlja.
Pastoralni center je ena prvih muzejskih postavitev v Sloveniji, kjer nam je omogočen ogled artefaktov
preko steklenih tal v sklopu razstave
Mesto pod mestom. Predstavljene so arheološke ostaline zidanih
struktur, odkritih z arheološkimi raziskavami v letih 1995-1996, ki sodijo časovno v tri glavne faze. V prvo,
poznoantično, spadajo ostanki kamnitega obrambnega obzidja in vanj vključenega pravokotnega stolpa iz
5. stoletja. Drugo fazo predstavljajo ostanki neke podkletene stavbe in mestnega obzidja iz konca 14. ali
začetka 15. stoletja, tretjo pa ostanki drugega, proti vzhodu pomaknjenega srednjeveškega obzidja in
povečane podkletene stavbe iz zadnje četrtine 15. stoletja. V kletnem delu so poleg ostankov kamnitih
struktur predstavljeni tudi posamezni predmeti, najdeni pri arheoloških izkopavanjih na prostoru
pastoralnega centra in na območju poznoantičnega grobišča ob Lahinji. Pastoralni center je namenjen
različnim prireditvam, v prostorih so občasne umetniške razstave, konference, predavanja in drugi
dogodki.